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 內科醫學
- 內科部於民國79年10月正式作業，初期分為胃腸科、心臟科、胸腔內科、新陳代謝科、腎臟科、感染科、血液科（後改為血液腫瘤科）、過敏免疫風濕科、神經內科、呼吸治療科及精神科11科。
- 民國82年，本院獨立升格為醫學中心，精神科脫離內科部成為獨立科。為達成整合型照護，另設有加護醫學中心、心臟血管中心、老年醫學中心、呼吸療護中心及感染病房。民國84年增設加護醫學科。為配合衛生署“畢業後一般醫學訓練計劃”，改進現行過度專科化之住院醫師訓練制度，於民國92年以任務編組之方式成立一般醫學內科。
- 本部各科之發展完整齊一，與南部各醫學中心相比毫無遜色。其中特別具有領導優勢地位的項目，包括胃腸科的胃腸道內視鏡，尤其是膽道結石及食道靜脈瘤出血內視鏡治療，以及肝癌的高週波灼燒法。心臟科則在心導管治療冠心病，以及心律不整病患置放心內節律器。胸腔內科在阻塞性呼吸道疾病與胸腔腫瘤的診治，表現傑出。感染科在院內感控有專長，尤其在SARS侵襲南部地區時，表現特別優異，此外有關肺結核、愛滋病及退伍軍人症的研究，在南部也無出其右。本院神經內科對青年型中風及失智老人巴金森氏症的病因研究與照顧，在南部都佔一席之地位。腎臟科在急性腎衰竭研究、中毒急救、毒物諮詢方面成果豐碩，過敏免疫風濕科之全身性紅班狼瘡與關節炎治療表現傑出。內科部為因應醫療生態，就本科系已發展成熟之技術，為持續服務病患及研究發展，積極努力規劃之未來方向為：成立「膽胰道疾病內視鏡診療中心」、「門脈高壓合併症治療中心」、「南部冠心病治療中心」、「血液病治療中心」、「臍帶血、造血幹細胞組織庫」、「南部臨床毒物諮詢中心」、「南台灣巴金森症治療及研究中心」、「腦中風治療中心」、「常見感染症之研究中心」、「推廣風濕免疫疾病衛教、腎臟病防治衛教與糖尿病衛教工作」、「整合性呼吸照護系統」、「肺癌診療中心」等，並配合資訊電子化作業，及整合南部醫療院所，以資源共用方式達到病患更完善之醫療照護服務。
- 復健科目前作業內容包括：
物理治療：以聲、光、電、水、冷熱、牽引及運動來治療病患。
職能治療：日常生活訓練、手功能訓練、職前訓練、家庭自療指導、認知及知覺運動治療。
語言治療：語言障礙之評估與治療、吞嚥治療及聽障治療。
神經肌肉電刺激檢查：提供神經或肌肉病變之程度、性質，以為預期治療效果之評估標準。
精神部之醫療團隊由五大專業人員組成，包括醫師、護理師、職能治療師、臨床心理師及社會工作師，其中以主治醫師為醫療團隊之領導人，五大專業共同合作評估及診治病患之病情，以期給病患最適切及最人性化的醫療照顧。診治項目有精神分裂症、憂鬱症、躁鬱症、精神官能症、身心症等；醫療服務項目包括：急性病房及日間病房。此外，也有針對老人及兒童青少年的身心醫學治療、司法精神鑑定、家庭暴力加害人之評估及處遇之業務等。
- 皮膚科除一般醫療作業外，近年來更發展醫學美容包括果酸換膚（淡斑、除皺及去除青春痘疤痕）、維他命C離子導入及超聲波導入（黑斑、肝斑及各種色素沈澱斑）、鑽石微晶磨皮、雷射治療（點痣、除斑、磨皮、汗管瘤及血管瘤等）、脈衝光、紅/藍光治療、肉毒桿菌除皺術及皮膚檢測與美容諮詢等。
新購窄波紫外線B及紫外線A1機器，連同原有的多台紫外線(UVA、UVB)治療機與紅、藍光治療機，堪稱是全國最先進最齊全的光治療中心，可單獨或配合藥物來為乾癬、異位性皮膚炎、全身搔癢、白斑及多種皮膚疾患的病友提供全方位的治療計劃。使用皮膚生理檢測儀、過敏原貼膚試驗、薄層色層分析儀等來分析病人皮膚狀況，環境及職業暴露物質的鑑定與安全性、保養品的成份與效果等。
另外，我們也將綜合運用多種機器及注射物為美容門診的病人提供最適切、最貼心的完整治療。98年購入長脈衝銣雅鉻雷射(Gentle-YAG)治療機，可有效去除微血管絲，並可進行光波回春拉皮及快速有效除毛治療，使本院醫學美容陣容更臻完善。
- 家庭醫學部下分三科：社區醫學、安寧緩和醫學、及體檢科，服務內容大致分為五部份：
社區醫學：本服務以整合院內團隊促進社區健康為目的。成立「社區健康服務推廣委員會」，統籌醫院社區健康服務工作。
安寧療護：本院安寧病房（『崇德』病房）於民國87年11月9日正式開募啟用並收住病患，共有二十張床，提供末期病人身、心、靈的全人照顧，協助末期病患及家屬渡過生命艱困的時刻。
- 體檢作業：提供快速、半日、一日及公務員等多項體檢服務。以高品質服務、多樣化選擇、可信賴的報告、及方便的檢後追蹤為我們服務的目標。
- 門診服務：強調以提供整體性、連續性的人性化醫療照顧為理念，亦提供門診戒菸、門診減重、成人健檢、預防注射及門診保健等服務。
- 居家照護：主要由醫師、護理師及社工員組成，包含一般慢性病居家照顧及安寧居家服務。除一般護理及醫師定期訪視外，同時也提供諮詢、轉介及住院等協助。
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 醫療服務
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